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Rey_et_al_figures_supplementary_2025-12-23.docx Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos MS Word - 5.5 MB - MD5: b5c95407d6b594939f018cd73c2d8132 Documento original que contiene las figuras y sus leyendas. Las figuras fueron extraídas individualmente en el directorio `fair/figures`.
TableS5_PHASTER_LPU88-1.tab Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos Tabular Data - 21.3 KB - 18 Variables, 24 Observations - UNF:6:+hmTe/jKh+62AMr652Cvnw== Archivo original con los resultados de PHASTER y Phigaro para la cepa LPU88. Los datos fueron normalizados en fair/tables/table_s5.
TableS6_Phages_all_strains-1.tab Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos Tabular Data - 32.3 KB - 11 Variables, 261 Observations - UNF:6:dgihdmRFn1nAdeBiK87m+g== Archivo original con las predicciones de profagos para las 30 cepas. Los datos fueron normalizados en fair/tables/table_s6.
TableS7_ISescan_LPU88_2026-01-6.tab Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos Tabular Data - 6.8 KB - 24 Variables, 35 Observations - UNF:6:GqFkt0J9hqyCluUoIGxe5w== Archivo original con los resultados detallados de ISEscan para la cepa LPU88. Los datos fueron normalizados en fair/tables/table_s7.
TableS8_ISescan_all_strains_2026-01-6.tab Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos Tabular Data - 1.9 KB - 7 Variables, 30 Observations - UNF:6:Q9CYveHaClw/93q5zyP4Pw== Archivo original con los resúmenes de ISEscan para las 30 cepas. Los datos fueron normalizados en fair/tables/table_s8.
figure_s01.png Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos PNG Image - 143.6 KB - MD5: b32ee67ed0dcae37ba1805969217409d Gene arrangement of nod, nif and fix genes of the S. meliloti pSymA 2011 and pSmeLPU88c. The homologous coding sequences (CDS) are highlighted in matching colors and connected by greys bars, indicating the percentage of amino acid identity
figure_s02.png Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos PNG Image - 34.5 KB - MD5: ea919562bf001d51c186d717eb5e590c Barplot of the pangenome matrix with the chromosome of S. meliloti 30 sequences. The genes were assigned to each cluster: cloud, shell, soft core and core. 1391 genes are shared among the 30 chromosome sequences
figure_s03.png Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos PNG Image - 15.0 KB - MD5: 44422ccd503739cac747e345787cabcb Barplot of the pangenome matrix with the pSymB of S. meliloti 30 sequences. The genes were assigned to each cluster: cloud, shell, soft core and core. 664 genes are shared among the 30 pSymB sequences
figure_s04.png Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos PNG Image - 39.4 KB - MD5: 8b0344a810c065c6a73ddf0d1b7c1657 Barplot of the pangenome matrix with the pSymA of S. meliloti 30 sequences. The genes were assigned to each cluster: cloud, shell, soft core and core. 664 genes are shared among the 30 pSymB sequences
figure_s05.png Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos PNG Image - 143.6 KB - MD5: f7e8affb705e1c5a73b4582356d9dc11 Distribution of 137 unique genes from strain LPU88 across COG categories. The number of genes assigned to each COG category is shown

Rey_et_al_figures_supplementary_2025-12-23.docx

Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos

MS Word - 5.5 MB -

Documento original que contiene las figuras y sus leyendas. Las figuras fueron extraídas individualmente en el directorio `fair/figures`.

TableS5_PHASTER_LPU88-1.tab

Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos

Tabular Data - 21.3 KB - 18 Variables, 24 Observations -

Archivo original con los resultados de PHASTER y Phigaro para la cepa LPU88. Los datos fueron normalizados en fair/tables/table_s5.

TableS6_Phages_all_strains-1.tab

Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos

Tabular Data - 32.3 KB - 11 Variables, 261 Observations -

Archivo original con las predicciones de profagos para las 30 cepas. Los datos fueron normalizados en fair/tables/table_s6.

TableS7_ISescan_LPU88_2026-01-6.tab

Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos

Tabular Data - 6.8 KB - 24 Variables, 35 Observations -

Archivo original con los resultados detallados de ISEscan para la cepa LPU88. Los datos fueron normalizados en fair/tables/table_s7.

TableS8_ISescan_all_strains_2026-01-6.tab

Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos

Tabular Data - 1.9 KB - 7 Variables, 30 Observations -

Archivo original con los resúmenes de ISEscan para las 30 cepas. Los datos fueron normalizados en fair/tables/table_s8.

figure_s01.png

Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos

PNG Image - 143.6 KB -

Gene arrangement of nod, nif and fix genes of the S. meliloti pSymA 2011 and pSmeLPU88c. The homologous coding sequences (CDS) are highlighted in matching colors and connected by greys bars, indicating the percentage of amino acid identity

figure_s02.png

Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos

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Barplot of the pangenome matrix with the chromosome of S. meliloti 30 sequences. The genes were assigned to each cluster: cloud, shell, soft core and core. 1391 genes are shared among the 30 chromosome sequences

figure_s03.png

Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos

PNG Image - 15.0 KB -

Barplot of the pangenome matrix with the pSymB of S. meliloti 30 sequences. The genes were assigned to each cluster: cloud, shell, soft core and core. 664 genes are shared among the 30 pSymB sequences

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Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos

PNG Image - 39.4 KB -

Barplot of the pangenome matrix with the pSymA of S. meliloti 30 sequences. The genes were assigned to each cluster: cloud, shell, soft core and core. 664 genes are shared among the 30 pSymB sequences

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Apr 6, 2026 - Análisis Genómico Comparativo de Sinorhizobium meliloti LPU88: Diversidad de Plásmidos y Mecanismos Conjugativos

PNG Image - 143.6 KB -

Distribution of 137 unique genes from strain LPU88 across COG categories. The number of genes assigned to each COG category is shown

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